“殺菌”一詞涵義并不僅限于“殺死”病原微生物生長或孢子萌發兩層含意。能夠把病原微生物殺死的殺菌劑起殺菌作用，能抑制病 原物孢子萌發或生長的殺菌劑起抑菌作用，這兩種作用都可以在農業生產上達到防病和治病的目的。殺菌劑的作用方式不同，使用方 法也各異，但從根本上來說，殺菌劑防治病害的原理不外乎三種，即化學保護，化學治療和化學免疫。

    化學保護有“未見兔子先撒鷹”的意思，就是在病患發生前進行預防性質的處理。常見的殺菌劑中有些殺菌劑的保護措施一般只有 兩種：一、在病原菌的來源處施藥清除侵染源。通過施用殺菌劑消滅或減少侵染源的目的就是要減少病原菌對作物造成侵染的可能性 。例如冬季清除果園內雜草，消滅越冬病菌；種菌消毒和土壤消毒等具體手段都屬此類化學保護措施。二、在可能被病原菌侵染的需 保護對象上噴灑殺菌劑，防止病原菌侵染。

    化學治療就是“見了兔子方撒鷹”，農業生產上較為常用，其它應用行業不多見。即在植物發病或感病后才施用殺菌劑使之對被保護的作物或者對病原菌起作用，改變病原菌的致病過程，從而達到減輕或消除病害的目的。預防重于治療，防病的效果也優于治病的效果。根據病原對植物的侵染程度和用藥方式可以把化學治療分為三種類型：一種為表面化學治療；一種是內部化學治療；一種是外部化學治療。