殺菌劑在實際使用時，受到多重因素的影響。

1.1 殺菌劑
(1)殺菌劑抑殺微生物的特性是由其化學結構決定的，擁有對微生物起毒害作用的活性基團（或元素）是殺菌劑的基本條件。
(2)殺菌劑的理化性能，包括溶解性能，揮發性能，穩定性能 等直接影響著殺菌劑在保護對象中的分散性、對目標微生物細胞壁和原生質膜的通透性、活性基團安全到達作用部位等。
(3)除了少數例外，一般來說，殺菌劑的使用濃度越高，對微生物的抑殺作用越大，但在應用中應結合安全性、經濟性等因素綜合考慮。
1.2 微生物
(1)目標微生物的種類 不同種類的微生物在細胞構造、生理特性、體內代謝等方面存在著差異，有的差異較大，如細菌和真菌之間，前者屬于原核生物，后者屬于真核生物，前者細胞壁的主要成分為肽聚糖，后者的細胞壁主要由幾丁質構成等。有的差異較小 如同一個屬的各類菌。由于有這樣那樣的差異，所以各種微生物對殺菌劑作出的反應也不盡相同：
①細胞壁成分的差別影響著殺菌劑進人細胞的難易；
②原生質膜結構的差異造成了膜對物質通透性的差異，對殺菌劑能否順利接觸作用部位有著重大的影響；
③微生物細胞內的代謝途徑中是否存在著受殺菌劑攻擊的作用點，這個作用點對'這種微生物又是不是“致命”的，關系到殺菌效果的有無和大小；
④有些種類的微生物具有分解殺菌劑尤其是有機殺菌劑的本領，使殺菌劑失效；
⑤有些微生物還會對某些殺菌劑產生抗藥性。
(2)微生物的起始污染量 研究證明，當材料或產品污染微生物數量特別大時，原來效果表現得很好的殺菌劑也常常失去其保護作用，原因可能是：
①當微生物大量繁殖時，會分泌出一些保護性的物質，把菌體包裹起來，使殺菌劑不能與之接觸，因而起不到應有的作用，如微生物分泌的蛋白質保護層使季銨化合物、尼泊金酯、酚醛、含汞制劑失去殺菌活性；
②大量的微生物在被殺死時消耗了大量的殺菌劑并使之降至有效殺菌濃度以下，使殘存的菌又很快繁殖起來。有人在研究抗壞血酸對生胞梭菌(、C. sporogenes)的芽胞殺菌效果時發現，若用0.2% 抗壞血酸，在75℃處理60min，每毫升10 (2)芽胞時，殺菌率為99%， 而每毫升10(6)個芽胞時，殺菌率僅為37%。
1.3環境條件
(1)溫度可以通過幾種方式起作用：
①當溫度升高時，增加了微生物細胞原生質膜的通透件，甚至會對膜造成損傷，使殺菌劑更容易進入作用部位；
②溫度升高，殺菌劑的穿透能力增強，擴散速度加快，便于迅速通過障礙，到達作用部位；
③溫度升高有利于在作用點上的殺菌劑與菌體代謝中間產物之間的生物化學反應，加速了殺菌劑效力的發揮。
已有實驗證明，苯酚對副傷寒桿菌的殺菌力，溫度每增加 10℃，殺菌力增強23倍。
(2)pH 值
①對微生物影響外界PH值的改變，可使微生物細胞壁或原生質膜的結構產生變化，從而影響了膜的通透性，使殺菌劑更難或更易到達作用部位。
②對殺菌劑活性的影響PH值對許多殺菌劑的抗菌性能影響很大：一些有機酸類防腐劑如苯甲酸、山梨酸、脫氫醋酸等是以分子形式起抑菌作用的，它們在pH≥7時會離解成負離子，失去抑菌活性；季銨鹽類殺菌劑，在堿性介質中有高的抑菌活性，而在值低時，抑菌活性很小；當PH值從5增到8時，布羅波爾的 M1C值從6,25mg/kg增加到10-25 mg/kg;凱松在PH>8的情況下易分解失去活性。
(3)溫度
①某些氣體殺菌劑的作用受環境相對濕度的影響，如環氧乙烷，相對濕度越高，殺菌效果越差。
②水分活度（AW）是表示保護對象中的水可被微生物利用的程度。每種材料均有一定的aw值，降低材料的Aw值，對殺菌劑的效果是有益的。反之，若aw值很大，也可值殺菌劑喪失其應有的保護作用。
1.4使用對象
工業殺菌劑的使用對象名目繁多，物質組成復雜（由一種或多種原料制成），狀態各異（固體、液體、裔狀、乳狀等），用途廣泛 (食用、日用品工業材料等）且生產、儲存、使用都有各自的要求。
然而，與物理狀態相比，工業材料與產品的物質成分對殺菌劑的效能發揮有更多方面的影響，以下試舉數例說明。
(1)正面影響——增效作用
①醇 有些殺菌劑是以醇作為溶劑的，濃度為20%的醇能產生較好的協同殺菌作用。
②抗氧化劑 丁基羥基苯甲醛是化妝品工業上應用最廣的抗氧化劑，對革蘭氏陽性菌和陰性菌有效，但對革蘭氏陰性菌作用的效果較差，它與尼泊金酯類合用能產生協同增效作用。
③表面活性劑 月桂酸甘油酯是一種抗革蘭氏陽性菌、霉菌和酵母菌的表面活性劑，如果與EDTA或丁基羥基甲苯合用，還可有效地抗革蘭氏陰性菌。
④EDTA 是一種廣譜殺菌增效劑，它通過螯合陽離子使革蘭氏陰性菌失去陽離子的保護，使防腐劑能滲進細菌的細胞壁，提高殺菌劑對革蘭氏陰性菌[如綠胺桿菌(Pseudomonas aerugimosa)]的活性。
⑤食品添加劑 如異丁酸、葡糖酚、維生素C及一些B族維 生素的絡合物對食品防腐劑有增效作用。
(2)負面影響——滯效作用
①含有高濃度蛋白質（氨基酸）的產品，一方面能通過菌體的包裹保護作用降低殺菌劑的抗菌活性，另一方面又能促進微生物的生長，使季銨類、酚類、含汞類殺菌劑的抑殺作用大大降低；
②含碳水化合物、滑石粉、膨潤土、金腐氧化物、纖維素等或分的產品可吸附殺菌劑，減弱其殺菌作用，如滑石粉可使尼泊金甲酯、苯甲酸的抗菌活性降低90%，羊毛脂可使季銨鹽失去活性；
③某些殺菌劑可和產品的一些成分形成氫鍵或螯合物，通過 “束縛”和“消耗”的方式，降低殺菌劑的效能；
④表面活性劑在溶液中達到某一濃度時會形成膠束，它們會吸引水相中的殺菌劑，使殺菌劑被嚴重吸收，例如，當 0.3% ~0.5%的聚山梨酸酯存在時，十六烷基吡啶氯化物、烷 基二甲基芐基氯化銨的抑制濃度需分別提高50倍和100倍，才能達到本來的抑菌效果；
⑤金屬離子會影響一些殺菌劑的穩定性，如硬水中的鈣鎂離子會影響凱松的穩定性或使布羅波爾失活，對季銨類殺菌劑也有拮抗作用

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